هزینههای عمومی و اجرایی جایزه از سوی علیرضا زرگر بنیانگذار و مدیر جایزه مهرگان تأمین میشود. در سالهای برگزاری جایزه فرهیختگانی ادبپرور و دوستدار علم و محیط زیست با کمکهای مالی خود به برگزاری جایزه مهرگان علم و ادب یاری رساندهاند:
- خانم شکوه فرگاه اهداکننده مبلغ نقدی جایزه مهرگان ادب، بخش رمان در سالهای 1379 تا 1385
- خانم دکتر اکرم طاهرپور اهداکننده مبلغ نقدی جایزه مهرگان علم برای بهترین کتاب در سالهای 1380 تا 1385
- خانم سودابه سلگی اهداکننده مبلغ نقدی جایزه مهرگان ادب برای بهترین رمان و مجموعه داستان از سال 1385 تا کنون
- آقای امیر زرگر حامی مالی بخشی از هزینههای برگزاری جایزه مهرگان از سال 1395 تا کنون
- آقای عزیز اثنیعشری حامی مالی بخشی از هزینههای برگزاری جایزه مهرگان در سال 1397
- خانم کتایون سلگی حامی مالی بخشی از هزینههای برگزاری جایزه مهرگان از سال 1399 تا کنون
- خانم کیانوش سلگی حامی مالی بخشی از هزینههای برگزاری جایزه مهرگان از سال 1399 تا کنون
همچنین تعدادی از داوران جایزه مهرگان ادب و مهرگان علم و جمعی از علاقهمندان به ادبیات و محیط زیست نیز خدمات خود را به صورت افتخاری در اختیار بنیاد جایزه مهرگان قرارداده و در پیشبرد امور اجرایی جایزه در بخشهای مختلف سهیم بودهاند.